（一）基本原則
1、發現感染應及時采集微生物標本作病原學檢查，二、三級醫院微生物標本送檢率不應低于70%。
2、盡量在抗菌藥物使用之前采集標本。
3、標本采集時應嚴格無菌操作，減少或避免機體正常菌群及其它雜菌污染。
4、標本采集后應立即送至細菌室。床旁接種可提高病原菌檢出率。
5、以棉拭子采集的標本如咽拭子、肛拭或傷口拭子，宜插入運送培養基送檢。
6、送檢標本應注明來源和檢驗目的，使細菌室能正確選用相應的培養基和適宜的培養環境。
（二）血液與骨髓的送檢方法
1、通常采血部位為肘靜脈。疑似細菌性心內膜炎時，以肘動脈或股動脈采血為宜，切忌在靜滴抗菌藥物的靜脈處采取血標本。
2、采血部位的局部皮膚應嚴格消毒。將采集的血液注入血培養瓶前，應更換針頭或過火消毒針頭。
3、每次采血量成人5~10ml，嬰幼兒1~2ml，培養基與血液之比以10：1為宜，以稀釋血液中的抗生素。
4、懷疑菌血癥因盡早采血，體溫上升階段采血可提高陽性率，但要防止因等待而延誤時機。對已用抗菌藥物而不能停藥者，可在下次用藥前采血。
5、對疑為細菌性骨髓炎或傷寒病人，在病灶或髂前（后）上棘處嚴格消毒后抽取骨髓1ml 作細菌培養。
（三）尿液的送檢方法
1、中段尿：女性采樣前應先用肥皂水或0.1%高錳酸鉀溶液沖洗外陰部及尿道口；男性須翻轉包皮沖洗，用0.1%新潔爾滅消毒尿道口，滅菌紗布擦干后，收集標本。
2、導尿管導尿采樣可減少污染。對留置導尿者，可用碘酒消毒尿道口處的導尿管壁，用聯空針筒的細針斜穿管壁抽吸尿液；或拔去閉式引流的集尿袋，棄取導尿管前段尿液，留無污染的膀胱內尿液數毫升送檢。不可從集尿袋的下端管口留取標本。
3、送檢標本以晨起*次尿為宜。
4、室溫下尿標本擔擱稍久可導致尿內細菌濃度明顯增加而影響病原菌與污染菌的區分。不能立即送檢者，可暫存4℃冰箱。
（四）痰標本的送檢方法
1、咳痰：清水反復漱口后用力咳痰，從呼吸道深部咳出新鮮痰液于無菌容器送檢。痰量極少者可用45℃10%氯化鈉溶液霧化吸入導痰。
2、對咳嗽乏力或昏迷病人，可用吸痰管經鼻腔或口抵達氣管腔內吸引痰液。用纖維支氣管鏡可直接在病灶部位采集高濃度的感染病原菌，但不能*避免咽喉部正常菌群感染。
3、雙側肺部感染伴人工氣道如氣管切開或氣管插管患者，可用吸痰管經人工氣道估插至葉支氣管水平吸引痰液。
4、痰標本不能及時送檢者，可暫存4℃冰箱。室溫下擔擱數小時定植于口咽部的非致病菌呈過度生長而肺炎鏈球菌、葡萄球菌和流感嗜血桿菌檢出率明顯降低
（五）手術創口、燒傷創面于膿液
1、無菌生理鹽水擦洗病灶表面后，用棉拭子采取病灶深部的膿液和分秘物，置運送培養基內送檢。
2、對未潰瘍的膿腫宜用碘酒、酒精消毒皮膚后，以無菌注射器抽取膿液送檢；也可于切開膿腫時用無菌棉拭子采樣。
3、采樣前病灶局部應避免用抗菌藥物或消毒劑。
（六）糞便的送檢方法
1、排便后，挑取有膿血、黏液部分的糞便2~3g（液狀糞便則取絮狀物），盛于蠟紙袋內送檢。
2、對不易獲取糞便者或嬰幼兒，可用肛拭采集。將拭子前端用無菌甘油水濕潤。然后插入肛門約4~5cm（幼兒約2~3cm）處，輕輕旋轉擦取直腸表面黏液后退出，置運送普及內送檢。
（七）咽拭、口腔拭子的送檢
1、病人清水漱口后，由檢查者將其舌外拉時懸幽垂盡可能向外牽引，棉拭子越過舌根到咽后壁或懸幽垂的后側，反復擦拭數次，插入運送培養基。棉拭子應避免觸及舌、口腔黏膜和唾液。
對化膿性扁桃體炎或口腔念珠菌病，用棉拭
臨床標本的處理
1、血標本
1． 1常見細菌
革蘭陽性菌：肺炎鏈球菌、金葡萄球菌、表皮葡萄球菌、溶血性鏈球菌、糞腸球菌、類白喉棒狀桿菌、產單核李斯特菌等。
革蘭陰性菌：腦膜炎奈瑟菌、卡他布蘭漢菌、傷寒沙門菌、流感嗜血桿菌、大腸艾希菌、變形桿菌、產汽腸桿菌、銅綠假單孢菌、肺炎克雷伯菌等。
1．2臨床意義
血液培養應用于傷寒、副傷寒、化膿性細菌和其他革蘭陰性桿菌引起的敗血癥的診斷。
目前引起敗血癥的細菌多為金葡萄球菌和大腸艾希菌。
疥、癰和膿腫繼發的敗血癥主要是金葡萄球菌和溶血性鏈球菌引起。
尿道、膽、胃腸黏膜損傷引起的敗血癥以大腸艾希菌多見，其次為變形桿菌、產汽腸桿菌、葡萄球菌。
急性細菌性心內膜炎以金葡萄球菌、溶血性鏈球菌、腦膜炎奈瑟菌常見；亞急性心內膜炎以草綠色鏈球菌多見，偶見腸球菌；化膿性心包炎以金葡萄球菌、溶血性鏈球菌、肺炎鏈球菌多見。
血液病、肝硬化引起的敗血癥金葡萄球菌和銅綠假單孢菌為主。
彌漫性血管內凝血以革蘭陰性桿菌為主。
燒傷后敗血癥以銅綠假單孢菌為主。
3、 痰標本
常見細菌： 肺炎鏈球菌、化膿性鏈球菌、金葡萄球菌、結核分枝桿菌；腦膜炎奈瑟菌、卡他布蘭漢菌、肺炎克雷伯菌、大腸艾希菌、銅綠假單孢菌、沙雷菌、流感嗜血桿菌。
痰標本：須接種2個血平板,一個放普通孵箱,另一個放CO2孵箱.痰標本接種于血平板、麥康凱平板、巧克力平板。巧克力平板是用來篩選流感嗜血桿菌。肺炎鏈球菌和流感嗜血桿菌的檢出率是衡量一個細菌室水平的重要依據，因此對于包括以上兩種菌在內的苛養菌的鑒定應引起重視。痰標本接種時，*區劃完線后，接種環必須過火消毒，否則將達不到分區的效果。
痰標本建議接種2個血平板、一個巧克力平板、一個麥康凱平板。 痰標本于咽標本的處理基本相同。
4、 尿標本
常見細菌：大腸艾希菌、葡萄球菌、變形桿菌。
注意事項：尿標本不能離心，離心將使污染菌也集中于沉淀部分，導致錯誤結果。一般而言，菌落大于105/ml代表真正感染，103/ml以下表示污染，104～105為懷疑污染，如病人的排尿速度太快或接受藥物治療或尿的pH小于5.0，比重小于1.003時，細菌的數目可能降低。因此病人若已服用抗生素，104菌落即需進行鑒定和抗生素藥敏試驗。